1、苦瓜不宜和含钙高的食物一起食用
苦瓜当中含有草酸，这种物质遇到了离子钙容易形成草酸钙，不仅会妨碍食物中钙的吸收，会形成结石，加重肾脏的负担。因此吃苦瓜的时候，尽量不要搭配高钙食物，如猪大排、牛奶、奶油和芝士等。对于需要大量补钙的的人来说，不能吃太多生苦瓜，可以在吃之前用沸水焯一下，去除草酸。
2、苦瓜不宜与生黄瓜、南瓜一起食用
苦瓜当中含有丰富的维生素C，其中维生素C的含量居瓜类蔬菜之首，一种抗氧化酶剂，对于美白，抗老化具有很好的效果，由于生黄瓜，南瓜当中含有维生素C分解酶，一起使用会破坏苦瓜功效，所以不宜一起使用。但炒熟的生黄瓜或南瓜不会破坏维生素C。
3、苦瓜不能与鱼腥草，茶一起食用
从中医角度来讲，苦瓜味甘苦性寒，鱼腥草其性寒，对于脾胃虚寒之人而言，苦瓜与鱼腥草食用，容易出现胃部不适，腹胀腹痛，甚至呕吐，腹泻等症状，所以不宜一起食用；茶中含有茶多酚，茶多酚会因食用苦瓜而加重脾胃虚寒。
4、苦瓜不宜与软壳类食物如虾一起食用
苦瓜当中含有丰富的维生素C，由于软壳类食物中含有浓度较高的五价砷化合物，与丰富维生素C一起使用会发生结合，会变成有毒的化合物，即砒霜。应避免一起食用。
